AlphaFold3, mille on välja töötanud Google DeepMind, on vabastatud mittetulunduslikuks kasutamiseks, võimaldades teadlastel tarkvara koodi alla laadida ja kasutada. 11. novembril välja kuulutatud versioon järgneb tüliolukorrale, kui DeepMind algselt takistas koodi avaldamist. AlphaFold3 kujutab endast märkimisväärset uuendust, kuna see suudab modelleerida valke koos teiste molekulidega, erinevalt oma eelkäijatest. Esialgu oli tööriist kättesaadav ainult veebiserveri kaudu, piirates teadlaste võimalust ennustada valkude käitumist potentsiaalsete ravimite juuresolekul. Pärast kriitikat reprodutseeritavuse osas on DeepMind nüüd vabastanud avatud lähtekoodiga versiooni, kuigi ainult teadlased saavad taotleda treeningkaalusid. Mitmed teised ettevõtted on loonud avatud lähtekoodiga tööriistu, mis on inspireeritud AlphaFold3 spetsifikatsioonidest, sealhulgas Baidu, ByteDance ja Chai Discovery, kuigi need ei ole litsentsitud äriliseks kasutamiseks.

Kuid Chai Discovery mudelit Chai-1 saab kasutada veebiserveri kaudu ravimite avastamiseks. San Francisco Ligo Biosciences pakub vähem piiratud versiooni, kuid see ei ole täisvõimekusega. Erinevad meeskonnad teevad jõupingutusi täielikult avatud lähtekoodiga versioonide arendamiseks, näiteks oodatav OpenFold3, mis lubaks ravimifirmadel mudelit ümber koolitada, kasutades omanditud andmeid jõudluse tõstmiseks. Valdkonnas toimub jätkuvalt arutelu avatuse üle, kus mõned eksperdid, nagu Columbia Ülikooli Mohammed AlQuraishi, pooldavad täielikult avatud mudeleid. Anthony Gitter Wisconsin-Madison Ülikoolist toob esile vajaduse läbipaistvuse järele AI mudelite jagamisel. Vaatamata väljakutsetele on eeldatavasti AlphaFold3 avatud lähtekoodiga vabastamine innovatsiooni edendav, sarnaselt AlphaFold2-ga, mis tõi kaasa märkimisväärseid edusamme nagu valkude disainimine vähieesmärkide jaoks ja tähtsate valkude tuvastamine, mis on olulised sperma-muna kinnitumiseks. AlphaFoldi meeskonna juht John Jumper väljendab põnevust tulevaste ootamatute kasutusvõimaluste osas, tunnistades nii ebaõnnestumise kui edu potentsiaali.