O AlphaFold3, desenvolvido pelo Google DeepMind, foi lançado para uso não comercial, permitindo que cientistas façam o download e utilizem o código do software. Anunciado em 11 de novembro, o lançamento veio após polêmicas, já que o DeepMind inicialmente reteve o código. O AlphaFold3 representa uma atualização significativa, pois pode modelar proteínas juntamente com outras moléculas, ao contrário de suas versões anteriores. Inicialmente, a ferramenta estava acessível apenas por meio de um servidor web, limitando a capacidade dos cientistas de prever o comportamento de proteínas na presença de potenciais medicamentos. Após críticas sobre a reprodutibilidade, o DeepMind agora lançou uma versão de código aberto, embora apenas acadêmicos possam acessar os pesos de treinamento sob solicitação. Várias outras empresas desenvolveram ferramentas de código aberto inspiradas nas especificações do AlphaFold3, incluindo Baidu, ByteDance e Chai Discovery, embora essas não sejam licenciadas para uso comercial. No entanto, o Chai-1, modelo da Chai Discovery, pode ser acessado através de um servidor web para descoberta de medicamentos.

A Ligo Biosciences, de São Francisco, oferece uma versão menos restrita da ferramenta, mas sem capacidades completas. Estão em andamento esforços de várias equipes para desenvolver versões totalmente de código aberto, como o esperado OpenFold3, que permitiria que empresas farmacêuticas reentreinassem o modelo usando dados proprietários para melhorar o desempenho. O debate sobre abertura na área continua, com alguns especialistas, como Mohammed AlQuraishi da Universidade de Columbia, defendendo modelos totalmente abertos. Anthony Gitter, da Universidade de Wisconsin-Madison, destaca a necessidade de transparência ao compartilhar modelos de IA. Apesar dos desafios, espera-se que o lançamento de código aberto do AlphaFold3 promova inovações semelhantes às vistas com o AlphaFold2, que levaram a avanços significativos, como o desenho de proteínas para alvos de câncer e a identificação de proteínas cruciais para a ligação espermatozoide-óvulo. John Jumper, líder da equipe AlphaFold, expressa entusiasmo para futuros usos inesperados, reconhecendo tanto o potencial para falhas quanto para sucessos.