Í dag afhjupuðu vísindamenn það sem þeir halda fram að sé stærsta gervigreindarlíkan (AI) sem miðar að líffræðirannsóknum. Þetta líkan, þjálfað á 128. 000 genum sem tákna fjölbreytt úrval lífs, allt frá mönnum til einfrumunga baktería og archaea, hefur getu til að búa til fulla litninga og smá gen frá grunni. Það er einnig mjög þróað í að túlka til staðar DNA, þar á meðal erfiðar 'ó-kóðandi' genaafbrigði tengd sjúkdómum. Líkaninu, sem kallað er ‘ChatGPT fyrir CRISPR, ’ var samvinnuþróað af teymum við Arc Institute og Stanford háskólann í Palo Alto, Kaliforníu, ásamt örgjörvaframleiðandanum NVIDIA. Aðgangur er veittur í gegnum vefviðmót, og vísindamenn geta sótt frjálst fáanleg forritunarkóða, gögn og önnur breyta sem nauðsynlegar eru fyrir líkanendurnýjun. Skapendur sjá fyrir sér Evo-2 sem fjölhæfa vettvang fyrir rannsóknaraðila til að sérsníða að þörfum sínum. Við blaðamannafundinn um frumsýningu Evo-2, tjáði Patrick Hsu, lífverkhEngineer við Arc Institute og Háskólann í Kaliforníu, Berkeley, spennu sína um hvernig vísindamenn og verkfræðingar gætu smíðað þennan 'app búð' fyrir líffræðilega nýsköpun. Viðbrögð annarra vísindamanna undirstrika forvitni þeirra um líkanið, sem er lýst í grein sem er aðgengileg á vefsíðu Arc Institute og send í fyrri prentþjónustuna bioRxiv. Þó að þau leggja áherslu á nauðsyn þess að sjálfstæðar mat séu gerðar áður en endanlegar niðurstöður eru dregnar. „Við þurfum að sjá hvernig það framar í sjálfstæðum mælingum eftir að drengjaprentin er aðgengilegt, ” sagði Anshul Kundaje, reiknigenóm tókandi við Stanford háskólann. Hann er núna heillaður af verkfræði bakvið líkanið. Á síðustu árum hafa rannsóknaraðilar skapað sífellt þróaðri ‘prótein tungumálalíkön’ eins og ESM-3, sem þróað var af fyrrverandi starfsmönnum Meta. Þessi líkan, þjálfað á milljónum próteina, hefur verið mikilvæg í að spá fyrir um byggingu próteina og hanna alveg ný prótein, þar á meðal genskrásetjara og flúrófensmál. Gervigreind hefur lagt fram fjölmarga nýja próteina, en árangur þessara sköpunar er enn óviss. Í andstöðu við önnur líkön, var Evo-2 þjálfað með genagögnum sem fela í sér bæði ‘kóðandi raðir, ’ sem sjá um framleiðslu próteina, og ó-kóðandi DNA sem stjórnar virkni gena.

Fyrst útgáfu Evo, sem gefin var út í fyrra, var einbeitt að genum 80. 000 frumna, sem fela í sér bakteríur, archaea, og tengd veirur. Nýjasta líkanið byggir á gagnasafni 128. 000 genum frá fjölmörgum tegundum, þar á meðal mönnum, öðrum dýrum, og plöntum, sem tákna samanlagt 9. 3 billjón DNA bókstafi. Í ljósi útreikningakrafna til að vinna úr þessum víðtæku gögnum, segir Hsu að Evo-2 sé stærsta líffræðilega AI líkan sem hefur verið gefið út hingað til. Eukaryotic gen, eins og þau finnast í lífverum utan prokaryota, eru almennt flóknari og lengri. Þessi gen hafa samanblandaðar raðir af kóðandi og ó-kóðandi svæðum, þar sem stjórna DNA er stundum staðsett langt frá genum sem þau hafa áhrif á. Þar af leiðandi var Evo-2 hannað til að þekkja mynstur í DNA raðir sem geta verið allt að 1 milljón basapörum í burtu. Til að sýna getu sína í að túlka flókin gen, nýttu Hsu og samstarfsmenn hans Evo-2 til að greina áður rannsökuð stökkbreytingar í BRCA1 geninu, sem tengist brjóstakrabbameini. Líkanið náði næstum því sömu frammistöðu og bestu bio-AI líkönin í að greina áhrif stökkbreytinga í kóðandi svæðum tengdum sjúkdómum, og náði "frammistöðu á allra besta sviði fyrir ó-kóðandi stökkbreytingar. " Í framtíðinni gæti Evo-2 aðstoðað við að greina þessar flóknu breytingar í sjúklingagenum. Að auki mettu rannsóknaraðilar getu líkansins til að túlka ýmis einkenni flókinna gena, þar á meðal genin fyrir hrossa-mammút. „Evo-2 táknar verulegan framfarir í að skilja DNA reglugerðarmálfræði, " sagði Christina Theodoris, tölvulíffræðingur við Gladstone Institutes í San Francisco, Kaliforníu.