Egy nemrégiben készült tanulmány felfedte, hogy egy mesterséges intelligencia (AI) modell 500 millió évnyi molekuláris evolúciót szimulált egy új, előzőleg ismeretlen fehérje kódjának megtervezésére. Ez a fénylő fehérje, esmGFP néven, hasonlít a medúzák és korallok által előállított fehérjékre, és segíthet új gyógyszerek kifejlesztésében. A fehérjék, amelyek elengedhetetlenek a különböző testi funkciókhoz, beleértve az izomépítést és a betegségek leküzdését, aminosavakból állnak, amelyek sorrendje gének által van meghatározva. Az esmGFP fehérje csak számítógépes kódban létezik, és egy egyedülálló zöld fluoreszcens fehérjét képvisel, amelynek csak 58%-os a hasonlósága a legközelebbi ismert fluoreszcens fehérjével – amely egy módosított verziója a buboréktippes tengeri anemonákból származónak. Az esmGFP természetes létrehozása 96 genetikai mutációt igényelne több millió éven át. Az ESM3 néven ismert AI modellt az EvolutionaryScale vezette be, és független tudósok által validálták.

Az ESM3, ellentétben a hagyományos evolúciós folyamatokkal, kitölti a hiányos fehérjesorozatokat, kihasználva egy 2, 78 milliárd természetes fehérjéből álló hatalmas adatállományból szerzett ismereteket. Ez a hiánykitöltő megközelítés segít olyan potenciális fehérjeszerkezetek generálásában, amelyeket az evolúció esetleg nem hozott volna létre. A kutatók az ESM3-at a fehérjék tulajdonságainak felhasználásával képezték, lehetővé téve számára, hogy prediktíven és folytatva fehérje kódokat, hasonlóan ahhoz, ahogyan egy ember befejez mondatokat. E kutatás következményei kiterjednek a fehérjemérnöki alkalmazások különböző területeire, beleértve a gyógyszertervezést is. Bár a Bathi Egyetem szakértője, Tiffany Taylor elismeri az AI potenciálját a fehérjemérnökségben, figyelmeztet arra, hogy az ilyen modellek egyszerűsíthetik a természetes kiválasztás által alakított összetett folyamatokat, amelyek millió éven keresztül formálódtak.