En els últims cinc anys, les accions de Super Micro van pujar més d'un 3. 000%, i els seus ingressos es van duplicar fins als 7. 120 milions de dòlars, aconseguint un lloc a la llista Fortune 500. No obstant això, l'empresa ha enfrontat problemes comptables continus, arribant a un acord amb la SEC a l’agost de 2020 per suposades violacions i recentment acusada pel venedor en curt Hindenburg Research de continuar amb pràctiques qüestionables. Ara, Super Micro està sota un escrutini intensificat, ja que el seu auditor, Ernst & Young (EY), va renunciar durant una revisió en curs, un fet inusual al món financer que sol indicar conflictes interns greus. Després de la notícia, les accions de Super Micro van baixar un 33%. Els coneixements dels experts en governança suggereixen que hi ha desacords significatius entre la gestió i els auditors, la qual cosa alça banderes vermelles per als inversors. Super Micro va anunciar que no espera fer cap reformulació dels seus informes financers malgrat les preocupacions de EY. El comitè d'auditoria va iniciar una investigació especial després que EY va expressar alarmes sobre els informes financers de l'empresa el juliol passat, que encara està en curs. En una divulgació pública, Super Micro va minimitzar la gravetat dels problemes, però va afrontar crítiques després que EY va expressar una manca de confiança en la gestió i el comitè d'auditoria, destacant conseqüències potencialment greus per a l'empresa.

Una investigació de la SEC podria ser imminent, afegint-se a l'escrutini. Enmig d'aquestes controvèrsies, Super Micro va rebre una advertència de Nasdaq per no presentar el seu informe financer anual a temps. A més, l'empresa va executar recentment una divisió d'accions de 10 a 1 per millorar la liquiditat de les accions. A l'agost, Hindenburg Research va publicar un informe crític que al·legava diverses irregularitats financeres, cosa que va portar Super Micro a defensar-se contra les acusacions. L'empresa té una xarxa complexa de connexions familiars a nivell corporatiu, amb el cofundador CEO Charles Liang i la seva esposa involucrats, juntament amb familiars en rols clau. Super Micro confia molt en entitats familiars i rellevades per a diversos serveis, plantejant més qüestions sobre transparència i governança. De moment, els executius planegen adreçar-se als inversors durant una actualització programada per al Dia de les Eleccions, però encara hi ha una preocupació significativa pel que fa als problemes comptables continus i el seu impacte en les operacions i la reputació de l'empresa.